Dziennikarz śledczy Emil Żądło otrzymuje e-maila od mężczyzny, który twierdzi, że posiada sensacyjne materiały na temat zaginionego miasta, które poszukiwał m. in. brytyjski podróżnik Percy Fawcett. Dziennikarz umawia się na spotkanie z tajemniczym informatorem, ale nigdy do tego spotkania nie dochodzi. Informator zostaje zamordowany, a Emil Żądło jest proszony przez policję o pomoc w śledztwie. Przesłuchania rodziny i znajomych zamordowanego Milczanowskiego pozwalają ustalić, że denat od lat interesował się teorią zaginionego miasta. Kilkadziesiąt lat wcześniej znalazł w piwnicy skrytkę, w której ukryte były jakieś dokumenty, mapy i egzotyczny posążek. "Skarb" prawdopodobnie został ukryty w czasie II wojny światowej przez mieszkających wtedy w Gdańsku hitlerowców. Te przypuszczenia potwierdziły się, gdy już w czasach powojennych kamienicę nachodzili Niemcy, którzy rzekomo z sentymentu chcieli zwiedzić swoje dawne mieszkanie. Policja i dziennikarz próbują odnaleźć opisywane przez zamordowanego dokumenty i posążek, ale nigdzie ich nie ma. Sprawa komplikuje się, gdy giną dwie kolejne osoby - znajomi Milczanowskiego. W śledztwie pomaga Marta Zabłocka - konserwator zabytków.
"Zaginione miasto" to czwarta część serii, której głównym bohaterem jest Emil Żądło.